Boje bokserskih kaputa relativno su jednostavne. Svi čistokrvni boksači imaju crnu masku na njušci, iako ona može biti djelomično ili u potpunosti prekrivena bijelim oznakama.
Fawn
Smeđe je jednobojne boje, u rasponu od svijetle preplanule do tamno crvenkaste boje. Tamnije mladunce ponekad se nazivaju mahagoni ili jeleno-crvene boje - zapravo u nekim se zemljama za opis boje umjesto crvene koristi izraz "crvena". Tamnije smeđe dlake mogu imati neke crne dlake prošarane u kaputu ili dlake mogu biti prekrivene crnom. To može stvoriti mala crna područja ili se "razmazati" na dijelovima kaputa, posebno na rubovima ušiju.
Tigrasta
Druga boja u AKC bokserskom standardu je tigrasta, koja je crna na prugastom temeljnom premazu. Tehnički gledano, svi su bokseri blagi - tigra je uzorak obilježavanja, a ne stvarna boja. Ipak je puno lakše nazvati tigrastom bojom, a ta je konvencija dobro funkcionirala već stoljeće. Tikčasti bokseri mogu imati samo nekoliko pruga na svom ružičastom tijelu - ponekad u šali nazvanim "frindles". S druge strane spektra, pruge mogu biti dovoljno teške da, kako opisuje američki kinološki savez, "stvore privid obrnutog tihovanja", jer izgleda kao da su jelenje pruge naslikane na crnom tijelu. Osnovna boja smeđe smeđe boje uvijek bi trebala biti vidljiva, čak i ako se nalazi na samo nekoliko malih područja na tijelu.
Bijela
Bijela je još jedan obrazac obilježavanja - genetski su svi bijeli bokseri ili bijeli ili tigrasti ispod bijelog "bojenja". Količina bijelih oznaka može se znatno razlikovati, od nikakve do 100 posto pokrivenosti. Boksači s bijelim oznakama koji pokrivaju jednu trećinu ili manje tijela nazivaju se "blistavim". Te se oznake obično nalaze na stopalima, nogama, vratu i licu. Kad je većina tijela bijela, psa zovu bijelim bokserom - opet nije tehnički ispravno, ali tako je lakše. Bijeli bokseri često imaju mrlje u boji, obično na ušima ili oko očiju, a povremeno i na leđima. AKC pruža registracijske kodove i za bijele oznake i za bijelu boju.
Bijeli bokseri nisu rijetki ili neobični; iako se službena statistika nije vodila, razumna je procjena da je oko 20 posto svih boksača bijelaca. Psi s bijelom bojom koja pokrivaju više od jedne trećine tijela diskvalificirani su s izložbi pasa prema standardu pasmine, a etičkim kodeksom matičnog kluba zabranjeno im je uzgoj. Bijeli boksači mogu sudjelovati u poslušnosti, okretnosti, pastirstvu, coursingu, reliju i drugim aktivnostima.
Genetika
Genetika boja bokserskih kaputa je jasna. Tigrasta je dominantna u srneće, što znači da će pas s čak jednim gelom tigrastih biti tigrast. Modifikatori, umjesto gena tigrasta, određuju količinu tigrastih pruga na bokseru - pas s dva gena tigra može ili ne mora imati više pruga od psa s jednim tigrastim genom. Bijele oznake uzrokovane su ekstremnim genom piebald i one su dominantne. Pas s jednim bijelim genom bit će blistav, dok će pas s dva bijela gena biti uglavnom ili potpuno bijel.
Crno
Sve veći broj uzgajivača prodaje "crne boksere", koji se često prodaju kao "rijetki" i prodaju se po visokim cijenama. Nažalost, crni kaput genetski je nemoguć za boksača, a AKC ne sadrži kod boje za crnu boju. Jedini način da se dobije crni kaput je križanje boksera s drugom pasminom. Budući da je crna boja dominantna u svjetlucavoj i tigrastoj, ona se ne može "skrivati" generacijama; ako pas ima jedan gen za crnu boju dlake, imat će crni kaput.
